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【產品編號】2793950

【英文名稱】Locus-specific, quantitative 5fC analysis Kit

【中文名稱】特定位點5-醛基胞嘧啶定量檢測試劑盒

【產品內容】

產品組成

含量

溶液L1Buffer L1

2.4 mL

M

24

模式序列

24ul

注:溶液L1:丙二腈反應液;M:丙二腈

【保存條件】模式序列置于-20 °C,可保存12個月。

                     M和溶液L1置于4 °C,可保存12個月。

 M需避光保存。

【產品概述】

5-甲基胞嘧啶修飾(5mC)是真核細胞基因組中最為重要的表觀遺傳修飾之一。5mC可以在TET家族酶的作用下逐步氧化生成5-羥甲基胞嘧啶(5hmC)、5-醛基胞嘧啶(5fC)和5-羧基胞嘧啶(5caC);對于上述幾種新型DNA修飾的功能研究是目前核酸表觀遺傳學的一個研究熱點。

百靈威推出新型5fC檢測試劑盒,它主要用于5-醛基胞嘧啶(5-formylcytosine, 5fC)的全基因組單堿基分辨率測序;也可應用于5fC在生物發(fā)育和疾病發(fā)生發(fā)展過程的生物學功能研究。

【自備材料】

Oligo Clean & Concentrator (ZYMO, #D4060)

MightyAmp® DNA Polymerase Ver.3(TaKaRa, Cat.#R076A)

無水乙醇

滅菌超純水

低吸附EP、PCR

PCR熱循環(huán)儀

Thermo-mixer (Eppendorf)

【注意事項】  

A.避免樣品交叉污染

吸取不同樣品時更換槍頭

B.酶的取放應在冰上進行,為避免反復凍融或長期使用后活性下降,我們推薦您在首次使用后將剩余試劑小份分裝凍存

【實驗步驟】

起始材料:純化后的基因組DNA,溶于EB中。

DNA純度要求:OD260OD2801.82.0

1)在純化的基因組DNA中加入1ul M1ul溶液L11ul模式序列,充分混勻,將其置于Thermo-mixer (Eppendorf)中,37°C850rmp避光反應20h。

25fC標記完成后,按照MightyAmp® DNA Polymerase Ver.3(TaKaRa, Cat.#R076A)說明書對特異性的位點進行PCR擴增。

3)按照Oligo Clean & Concentrator (ZYMO, #D4060)說明書純化PCR后的DNA, 30ul 超純水洗脫,于-20°C保存。

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