【產品編號】2793950
【英文名稱】Locus-specific, quantitative 5fC analysis Kit
【中文名稱】特定位點5-醛基胞嘧啶定量檢測試劑盒
【產品內容】
產品組成
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含量
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溶液L1(Buffer L1)
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2.4 mL
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M
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24管
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模式序列
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24ul
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注:溶液L1:丙二腈反應液;M:丙二腈
【保存條件】模式序列置于-20 °C,可保存12個月。
M和溶液L1置于4 °C,可保存12個月。
M需避光保存。
【產品概述】
5-甲基胞嘧啶修飾(5mC)是真核細胞基因組中最為重要的表觀遺傳修飾之一。5mC可以在TET家族酶的作用下逐步氧化生成5-羥甲基胞嘧啶(5hmC)、5-醛基胞嘧啶(5fC)和5-羧基胞嘧啶(5caC);對于上述幾種新型DNA修飾的功能研究是目前核酸表觀遺傳學的一個研究熱點。
百靈威推出新型5fC檢測試劑盒,它主要用于5-醛基胞嘧啶(5-formylcytosine, 5fC)的全基因組單堿基分辨率測序;也可應用于5fC在生物發(fā)育和疾病發(fā)生發(fā)展過程的生物學功能研究。
【自備材料】
• Oligo Clean & Concentrator (ZYMO, #D4060)
• MightyAmp® DNA Polymerase Ver.3(TaKaRa, Cat.#R076A)
• 無水乙醇
• 滅菌超純水
• 低吸附EP、PCR管
• PCR熱循環(huán)儀
• Thermo-mixer (Eppendorf)
【注意事項】
A.避免樣品交叉污染
吸取不同樣品時更換槍頭
B.酶的取放應在冰上進行,為避免反復凍融或長期使用后活性下降,我們推薦您在首次使用后將剩余試劑小份分裝凍存
【實驗步驟】
起始材料:純化后的基因組DNA,溶于EB中。
DNA純度要求:OD260/OD280=1.8~2.0
1)在純化的基因組DNA中加入1ul M,1ul溶液L1和1ul模式序列,充分混勻,將其置于Thermo-mixer (Eppendorf)中,37°C,850rmp避光反應20h。
2)5fC標記完成后,按照MightyAmp® DNA Polymerase Ver.3(TaKaRa, Cat.#R076A)說明書對特異性的位點進行PCR擴增。
3)按照Oligo Clean & Concentrator (ZYMO, #D4060)說明書純化PCR后的DNA, 用30ul 超純水洗脫,于-20°C保存。